Allisons (Salli Richardson-Whitfield) bror Marcus (Dondre Whitfield) är och hälsar på sin syster, och eftersom han är en framstående forskare, precis som Allison, är han enormt känd. När de är ute på en rundtur i staden Eureka och på forskningscentrat flockar sig forskarna runt honom och vill ha hans autograf. En ung forskare (Erin Simms) berättar följande:

H.J. (Mark Gash) har uppfunnit en apparat som gör att han kan färdas mellan olika dimensioner ögonblickligen, i stort sett en slags transporterare från ställe A till ställe B. Dessvärre är att han inte riktigt fått ordning på prylarna och apparaten fixar i stället till så att vem som än vill transporteras hamnar i en slags mellan-dimension där man är fast.

Saker och ting är som vanligt i staden Eureka - med andra ord allt ovanligt. Just denna dagen har slumpvist utvalda saker från ett annat årtionde börjat dyka upp i Eureka och Jack Carter (Colin Ferguson) försöker tillsammans med Douglas Fargo (Neil Grayston) och Claudia Donovan (Allison Scagliotti) lista ut varför sådant händer:

Allison Blakes (Salli Richardson) son Kevin (Meshach Peters) har blivit "besatt" av en främmande energiklump som kom från en artefakt från rymden. Den genialiske Henry Deacon (Joe Morton) inser att enda sättet att rädda honom är att skicka honom genom en teleportör för att skilja Kevin från energiklumpen. Allison blir inte så glad när hon får reda på planen och Beverly Barlowe (Debrah Farentino) är absolut emot det.

Beverly: "Teleportation? But this is a banned technology. All active research was outlawed by the Stockholm treaty."

Något har gått fel i staden Eureka och som vanligt står världens undergång på spel. Gänget med polisen Carter (Colin Ferguson) har kommit fram till att någon eller något har framkallat och slängt antimateriapositroner runt omkring sig. Carter anar att det kan vara Zane (Niall Matter) som är boven i dramat, men Henry Deacon (Joe Morton) tar ner honom på jorden med följande:

Henry: "Creating antimatter positrons is incredibly difficult, so if Zane has found a shortcut, he wouldn't be playing jokes. He would be getting a Nobel prize."

Ända sedan människan var på månen och plockade med sig lite månstenar hem har de legat i ett labb på Global Dynamics i Eureka. Efter 40 år i dvala börjar de plötsligt växa och gröna kristaller växer upp ur dem. Nathan Stark (Ed Quinn) och Henry Deacon (Joe Morton) försöker komma på vad som har satt fart på den oväntade tillväxten. Deras konversation dem emellan i labbet låter så här:

När Douglas Fargo (Neil Grayston) ska sjösätta ett projekt som tagit tre år att utveckla är han inte lite stolt. Ett litet datachip klistras fast i nacken på datoranvändaren och sedan kan man koppla upp sig mot närmsta dator utan sladdar, utan möss, helt trådlöst. Något som Fargo tar fasta på när han berättar för chefen Nathan Stark (Ed Quinn) varför han har listat ut ett så finurligt namn på prylen:

Trubbelmakaren Fargo (Neil Grayston) har fått ett eget kontor, och inte vilket kontor som helst. Det ligger långt nere under jord i forskningskomplexet i staden Eureka, och det är i stort sett en liten skrubb som ingen satt sin fot i på tjugo-trettio år. När Fargo och hans vänner städar undan allt skräp hittar de en panel med massa knappar och två nyckelhål. Lätt korkade som de är letar de fram två nycklar i en låda i skrivbordet och sätter på den i tron att det är en stereo. Det är det naturligtvis inte utan det är en maskin som kontrollerar ett vapen som kan förstöra en hel stad.

För att undvika att köra på en hund hamnar sheriffen Jack Carter (Colin Ferguson) och hans dotter Zoe (Jordan Hinson) i diket på deras väg genom natten. Bilen blir så söndertrasad att de får gå till närmsta stad och söka hjälp. Staden de kommer till är Eureka, endast bebodd av forskare och människor med extrem hög intelligens, där i stort sett alla jobbar på den statligt stödda forskningsstationen där framtidens alla uppfinningar tas fram.